参考wikijp，大概说下这次Q的设定变化和故事流程。

剧透慎入~~首先是第二部新剧场版·破。绫波被使徒同化后，真嗣为了救绫波出来，令初号机觉醒，同时将第10使徒体内的绫波拉出来，吸入初号机。因此打开了神之门，发动了近乎毁灭全人类的第三次冲击。　　影片一开始巨神兵的攻击，不知道是真嗣的梦还是真实的第三次冲击全世界破灭的现象。（说是风之谷的巨神兵灭世特摄版，不过我觉得不单单是致敬那么简单吧）　　有趣的是，日文wiki里，没有直接用ThirdImpact描述真嗣在破里的那次冲击，而是用的ニアサードインパクト。NearThirdImpact？是这么翻么？　　所以可能那个和以前的冲击有些不同，不是全人类肉体爆裂，或许就是片子开始的打开神之扉后召唤无数巨神兵来毁灭世界，物理攻击。如果说，片头仅仅是《风之谷》的巨神兵特摄版的话，那可能是根据破的最后，渚薰从月球驾驶Mark6用枪令初号机停止了，所以没有造成全体人类死亡。不得而知。　　　　好，进入正剧。　　一开始是真嗣沉睡在初号机内14年，并且被Nerve封印在卫星轨道上。由幸存者的美里他们组织的新组织WILLE，派出2号机改和8号机去夺取初号机。打败了守护着初号机的Code4A（一开始袭击2号机的）和与初号机藏在一起的Code4B（带状）　　然后，在海洋中沉睡着巨大的母舰，那个其实是黑绫波驾驶的EVAMark9的外挂。可能是利用Mark9自己的动力来驱动，被美里他们抢夺，并且用初号机作为动力源替代（2号机改那个所谓的点火，感觉是类似心脏起搏器，把初号机的核心给激活并代入某容器中），同时击破了守护着母舰的Code4C（光柱和隐藏在下面的四个方块）。　　因为真嗣发动了神之门，所以美里他们给他装上了项圈，只要按动开关就能杀死他，阻止他再次驾驶EVA发动灭世程序。　　接着，元渡为首领的Nerve派出了黑绫波，用声音诱惑真嗣，并用全身都是核心的Mark9（外观，其实也就是EVA的壳子，很像零号机）将他带走。因为Mark9全身都是核心，所以随便打掉哪里都会再生。　　元渡让真嗣和第一使徒渚薰见面，让渚薰打开他的心结，并令真嗣看到了自己14年前对世界所作的一切。而真嗣也确定了，自己其实并没有把绫波救出来，同时还杀死了大部分的朋友以及世界上大部分的人。　　和冬月下棋中，冬月告诉真嗣，他的母亲本名叫做绫波唯（这个和原版不同，原版叫碇唯，六分仪元渡入赘碇家才改姓碇），为了做EVA的控制系统试验而被吞噬。凌波丽是用她的遗传数据制造的克隆人（这个也和原设定不同，原设定是莉莉丝的克隆人）。元渡利用他，让初号机吸收了凌波丽，同时天使化开启了神之门，发动了类第三次冲击，毁灭了世界上大部分的人和文明。　　当得知自己非但没救出绫波，还亲手毁灭了世界，同时一切都是父亲事先就设计好的残酷事实，真嗣彻底奔溃了。　　这个时候，渚薰开导他说，如果我们驾驶13号机，去地底下拔出朗基努斯和卡西乌斯两把枪，就可以改变世界，令一切还原。　　真嗣被这番话打动，但是此刻的他已经无法信任任何人。　　渚薰解开了他的项圈，戴在了自己脖子上，令真嗣终于放下了包袱，满怀着复原世界的希望，和渚薰一起进入了13号机体内。　　13号机的外观很像初号机，有四只眼睛，因为拔出两把枪需要两个灵魂，所以是双驾驶员系统。　　当两人潜入Nerve总部地下，见到了巨大的第二使徒莉莉丝的身体（头颅在元渡哪里）以及和他一起被两把枪刺穿的EVAMark6（注意，由元渡Nerve自行制作的EVA剧中用Mark来表示，地底的墨镜Mark6和本来是母舰主人，现在由黑绫波驾驶的Mark9）。因为Mark6是前一部剧场版最后从月球由渚薰驾驶来制止初号机继续第三次冲击的，所以后来可能还和地底的莉莉丝进行了战斗，最后两把枪互相刺透，莉莉丝的头颅被砍下。分别沉默并白化。　　此时，渚薰发现有些异样，本该是两把不同的枪朗基努斯枪和卡西乌斯枪，现在却是一模一样的都是朗枪，并列一对。　　而心切的真嗣完全不顾渚薰的警告，在击退前来阻止的2号机改后（他们驾驶的13号机比较特殊，没有AT立场，而是由自带的浮游炮来发动攻防一体的立场），分离渚薰的控制权，同时打开了另外两只手，拔出了两把朗枪。　　这个时候，绫波遵循元渡的命令，切断了mark6的头，令隐藏在体内的12号使徒出现（第一使徒是渚薰，第二使徒是莉莉丝，第三使徒骨龙在破的一开始被击破，第4-10使徒都在第三东京市被打败。目前唯一不明的是第十一使徒。）　　第十二使徒变成巨大的肉球和胎儿，被觉醒的13号机（也就是第十三使徒）吸收并咬碎了核心，令13使徒天使化（这个结合破结尾，第十使徒被初号机吞噬吸收并天使化类似），再次打开了神之门。　　渚薰意识到自己上了元渡的当，骗他接近真嗣开导真嗣，最后却把他堕落为13使徒，或者说是新的初号机利用。（剧中是说，最后的原版使徒是12号，渚薰由原版的第一号使徒变成了不存在的第十三号。我个人猜测是，他作为第一使徒亚当，应该是开启新世界的种子，结果却堕落为毁灭世界的恶魔）其实，所谓的第十三使徒，也就是和破中发动第三次冲击的初号机作用一样而已。　　通过元渡和Seele的交谈，我们知道，Seele设定也变了，是一种非人类的高等生命，赋予了人类文明。当关闭它们的电源后，也死去了。　　而且，渚薰说了，打开神之扉，自古以来就是一种灭世的程序，消灭旧的生命，创造新的生命，是一种进化的方式。而第三次冲击是元渡根据个人意志人工开启的，虽然进行到一半被终止了。　　美里的母舰出现，攻击天使化的13号机，被本来就是母舰主人的Mark9反控制住了操作权。为了消灭全身都是核心并且能无限再生的怪物，明日香在code777状态下的2号机改也无法在一瞬间毁灭Mark9全身，只好进行自爆，同时自己脱出。　　而黑绫波，也就是剧中所说的最初批次的绫波，问明日香你们认识的绫波此刻会怎么做时。明日香反问她，你觉得你会怎么做。仿佛被原先那个绫波的感情附体般，这个黑绫波选择了活下去，脱出了Mark9.　　Mark9和2号机改同归于尽，母舰得救。　　为了阻止第四次冲击，渚薰安慰了几乎歇斯底里的真嗣，将两把朗枪刺入13号机身体，令脖子上的项圈发动，杀死了自己。只是没想到双驾驶系统不单单是拔两把枪那么简单，一个人死去，另外一个人还可以维持神之门的开启。　　玛丽将真嗣的驾驶舱强制射出，终于令13号机天使化停止，坠落地上，神之门关闭，第四次冲击结束。---------------------------然后说下我看下来觉得有问题的几点：1.明日香在见到被砍掉头的Mark6后，钻出来的12号使徒说，“原来12号使徒还没死，要在第三次冲击继续前消灭它”。可见当初他们曾与11号，12号使徒战斗，以为将他消灭了。其实它躲藏在Mark6体内了。2.地下和巨大莉莉丝残骸一起的Mark6，渚薰说，被Seele改成了自律型，并且被李林（应该是指元渡）利用完牺牲掉了。如果说是被元渡和seele修改后用来战斗，那有可能是和12号使徒战斗，同时还把莉莉丝给卷进来了。导致莉莉丝头颅掉落，Mark6下半身和莉莉丝融合在一起。而以为被消灭的12号使徒其实潜伏在Mark6体内。作为后来发觉上当的渚薰，应该是曾经用过两把枪，所以知道两把枪在那里，然后被元渡掉包，变成同样的两把朗枪，同时元渡也知道12号使徒没死，这完全是一个骗渚薰的陷阱。又因为渚薰说14年内没人进来过，所以掉包和战斗都是14年前真嗣天使化之后紧接着发生的。11号和12号使徒的战斗，包括我猜测后面才是真正的第三次冲击，破里只是开头就结束了，后面发生的一切才是真嗣自己陷入睡梦中无法亲眼看见的真正的悲剧！这样的话，下一部剧场版会有很大篇幅是14年前的回忆，包括最后决战。3.元渡面对Seele说，“你们是改变了灵魂的形状生命体，也被赋予了智慧果实。虽然活了很久，但最后还是逃脱不了突然的死亡。并为了进行包含着死亡的进化，传授给我们人类文明。”难道Seele是被所谓的远古的神，或者说是远古的高智慧生命创造出来的人工智能么？改变了灵魂形状的生命体，被赋予了智慧果实应该就是给人工智能以知识和自律力。而靠电力存活的人工智能是可以无限活下去的，也就等于是半永久的生命果实。Seele应该就是神的奴仆，被神赋予了某种使命。比如说，不断地培养生命，授予他们智慧，然后发展，到一定程度，发现他们太肮脏，是个错误，就根据死海文书，毁灭掉重来，这样反复反复无数次，经过了极度漫长的时间。但是元渡又说：“人类的补完和弑神我都会办到！你们可以安息了。”这句话很有意思，仿佛是说，这些人工生命，或者说，简直就是传统意义的天使们，对神的束缚厌倦了，对灭世然后重生的反复试验困惑了，所以勾结了元渡，要反抗神，所以会有人造的EVA。简直就是堕天使么！最后Seele将一切交给了这个虽然改变他们剧本，但继承他们意志的碇元渡，安然死去（关机，阿门）。4.还有一个有意思的地方，一个是莉莉丝所在的地底，全是骷髅头颅，但是大家或许注意到了，那个骷髅头颅的尺寸，是和EVA等比的。包括渚薰给真嗣看得被毁灭的城市，好多类似EVA的尸体。我都在想，是不是这些是第三次冲击中出现的？难道是人类变的？？