Q——你可以重来（轮回的故事结构）

《Q》并不是沿着破末尾薰用枪阻止了第三次冲击的时间线发展而来的故事，所以我们觉得剧情与上一部衔接不上，好像中间跳过一节，正如第二部的副标题：YOUCAN(NOT)ADVANCE，你不能前进。庵野秀明似乎无意告诉观者在中央教条——第三次冲击爆炸中心——究竟发生了什么。唯一在《Q》里可以证实的是，月球表面出现了在旧版结局中同样的分裂、出血的痕迹。这应该是和在中央教条的Lilith变形成绫波同时发生的，在《破》接近结尾时有一个意味深长的镜头，初号机进入接近神的状态，而中央教条的Lilith安然无恙，这是否意味着在《Q》的故事线中觉醒后的初号机走向了中央区？所以才导致了《Q》中所看到的那些惨烈遗骸？薰很显然是当时的在场者，在下沉到教条的路上，他对那里14年中无人进入的封印状态进行了说明，降落后，与真嗣的震惊不同，他很清楚地知道那是Lilith的尸体，而MARK.06是改成自律型后被抛弃的结果。然而他疑惑的是，当初两把不同的枪，为何变成了两把一样的朗基奴斯枪。为什么一定两个灵魂才能拔枪？因为是两个灵魂封印的，Lilith变成了绫波，看过旧版结局的人都知道，这是绫波回归本体的结果，MARK.06改为自律型意味着没有驾驶员，因为MARK.06本身就是由疑似Adam的白色巨人改造而成的。碇源堂留了一手，他预先用一把朗基奴斯枪伪装成了卡西乌斯枪，或者是十四年中悄悄用某种手法将其中一把换掉了，于是才有了《Q》里的一幕。《破》结尾时，绫波化身巨大的血体（代表着Lilith的灵魂）与初号机融合，这是以Lilith为扳机的觉醒，呈气流状，头顶有光环。而在这一次，薰被骗了，切换成单人模式的13号机仅凭真嗣一人就拔出了两把枪，与薰同源于Adam的第十二使徒并未死亡，复苏后它将13号机缠裹起来，薰的身份立刻遭到显现，他沦为了第十三使徒（一个多余的使徒），13号机吞下了Lilith尸体的果实，引发了第四次冲击，这是以Adam为扳机的觉醒，通体洁白，背后有光环，这是薰没有料到的。薰是代表着seele一方的少年，他是第一使徒，Adams之一（注意，是复数），seele和NERV曾经是两种互相博弈的势力，所占有的资源也不同，然而在《Q》里，他们似乎达成了某种共识，有了同样的目的——弑神。薰是绝望的，他希望帮助真嗣，却被碇源堂利用引诱真嗣成功推进了第四次冲击，正如13这个数字所代表的，他成了犹大，一个出卖圣子的